надо посмотреть все настройки связанные с вьюпортом я полагаю.
Я честно говоря не очень в них, не помню что там можно включать и в каких комбинациях,
использовал майку для моделирования только и дефолтных мне обычно хватало.
еще когда какие-то непонятки с мешем были совсем уж заводящие в тупик, я иногда сохранял сетку в формат типа obj, чтобы там все отвалилось лишнее. Ну и снова импортнуть.
еще историю почистить надо обязательно. Ну вот сохранение в что-то такое общеупотребительное как раз историю тоже чистит.
у некоторых траблы с геометрией возникали, когда всякие отзеркаливания использовали и потом при загрузке все слетало и кривое становилось. Это из за координат скорее всего бывает. Тоже лечится в общем экспортом сетку в obj.
я на такую фигню уже стараюсь просто всерьез не реагировать.
В том же Блендере когда в FBX экспортишь, то вроде все размеры как надо стоят, а затягиваешь его в ZBrush, там все в десять или даже сто раз меньше масштабом

ну поправить то несложно, но все равно плюешься.
При этом если потом это из зебры опять в FBX экспортнуть и в Блендере открыть и потом обратно в зебру, то вроде как и масштаб уже правильно передается. В общем везде таких приколов хватает