1) Зачем их удалять? Лежат они и пусть валяются. Захочешь другой материал создать, кликаешь на Get Material (слева синий шар со стрелкой) и выбираешь нужный.
2) А если бы название было задано, ситуация не намного бы упростилась. В принципе там же в Get Material нужно переключиться на Browse From: -> Scene. Редактор покажет все материалы, используемые в сцене, а в скобках объекты, которым данный материал присвоен. Если нужно выделить объекты, которым присвоен определенный материал, то в редакторе выбираем нужный нам слот с материалом и кликаем на Select By Material (справа четыре кружочка со стрелкой).