Если я верно понял ваш вопрос, то возможно проблема заключается в том, что вновь созданные полигоны имеют другую группу сглаживания нежели окружающие их другие полигоны. Попробуйте выделить все полигоны вашего объекта и назначить им всем одну группу сглаживания, ну или отключить сглаживание вообще.