В простейшем случае сделай Optimize (при необходимости включи галочки, чтобы он учитывал группы сглаживания и материалы).
P.S. Если случай тяжёлый - то ручками. Где возможно - сделай Weld близкостоящим вертексам, где-то можно вообще "убить" часть вертексов, и затем ручками достроить нужные поверхности.