Что то я совсем вопрос не понял опиши подробней
1) ты использовал кости макса(Bones) или CS скалет (Biped)
2) на свой скин ты вешал модификатор skin
хотя если у тебя все сделано более мение правильно и при анимации не видно трансформации меша то может это из-за того что в Editable Mesh выбрана вершина или ребро или просто ничего не выбрано но включена кнопка выбора элементов меша тогда справа от модификатора появляется черный квадрат , убери выделение и все будет путем
А лутше опиши проблему точнее !!!
С наступающим