Save UI нужно, чтобы был сетап при переустановке зебры или при переходе в другую версию и т.п.
Если вдруг к примеру на этой установке зебры все сбросите к начальным настройкам по какой-то причине, то из сохраненного сетапа можно будет снова загрузить настройку интерфейса
Как-то так.
То есть Store Сonfig пишет состояние интерфейса в текущие настройки зебры, которые читаются при загрузке. А Save UI это просто запись во внешний файл на всякий случай и зебре при новом запуске про этот файл скажем так ничего неизвестно и вообще наплевать. Это чисто файл для вас