не корректная маска

[Михаил Коровянский]

PipeRouter

при наведении на соединение нод (оно станет желто-синим), кликнуть, зажав Alt.

добавить поле Underlay

в инструментах, он находится в Flow (например RMB->Add Tool->Flow->Underlay). быстрый вариант - выделить ноды, под которые хочется положить underlay, вызвать хоткеем Ctrl+Space скрипт AddTool, набрать underlay->Ok и он четко ляжет под выделенные ноды.

как сохранять работу с относительными путями

исключительно руками, либо написать скрипт, который будет парсить имя в лоадерах и сейверах и заменять часть пути на относительный.