В модо я могу нарисовать куб, повернуть его и сориентировать координатную систему по одному из полигонов
А потом рисовать меш по новой координатной системе
Если нужно выровнять один объект, то проще основную поверхность сделать Make life, и по ней, и интерактивном режиме создания добавлять примитив.
Или использовать инструмент Snap Together Tool.
