ты наверное мышОй трансформируешь. а попробуй через палитру Трансформ - увидишь разницу.
надеюсь, мы оба говорим именно о трансформации "паттерновой" заливки или градиента - и ни о чем другом?
кстати, аналогично будет себя вести трансформация объекта с примененным стилем (того, что в палитре Styles), если она основана на pattern или градиентах.