А в чем проблема то? Если ручку сделать, то не надо нижние полигоны выделять, только верхние, а сплайн продлить до точки пересечения ребер нижних полигонов. Если проблема в перекошенных полигонах, то достаточно соблюдать несколько условий, 1- количество сегментов сплайна желательно сделать равным количеству сегментов в Extrude Polygons Along Spline, поможет получить предсказуемую геометрию, 2 - чем больше угол изгиба сплайна, тем больше длина сегмента, она должна быть соразмерна длине ребра полигона, а противном случае получится перекошенная геометрия с пересечением полигонов.