Конечно, можно. Просто для простого монтажа эта программа избыточна...
Но, если под рукой больше ничего нет, делай примерно следующее:
Открывай в АЕ новый проект (скорее всего он уже открыт

), импортируй в него нужные тебе видеофрагменты и аудио (если уже есть...)
Жми Ctrl N - открывается новая композиция - задаешь нужный размер (тебе, наверное, нужно, чтобы полученное видео было такого же формата как и исходные видео фрагменты? Тогда указываешь этот размер...не забудь поставить нужный аспект пиксел, если они не квадратные ) Durartion сделай больше, чем общая длительность исходного видео.
Теперь кидай видео на таймлайн в той последовательности, как эти фрагменты должны идти (мышью). (курсор стоит в начале таймлайн, если нет - нажми Home на клаве.) Пока все фрагменты стоят друг под другом.
Выделяешь их все и заходишь в верхнее меню Animation/keyframe assistans/sequence layer. Если хочешь смотнировать фрагменты встык - не ставишь галку в overlap, если хочешь кроссфейд на стыках - указываешь нужное число кадров пересечения.
Теперь фрагменты должны выстроиться последовательно (если они посторились "наоборот" - значит ты начал выделять не с первого , а с последнего.
если уже есть звук - кидаешь его на таймлайн (курсор в начале)
если это wav - иногда АЕ его не хочет воспроизводить. Я эту проблему решаю заменой расширения wav на avi. (воспроизводится звук или нет можно проверить, нажав .(точку) на numeric keypad.)
Теперь выделяешь последний видеофрагмент на таймлайн, дважды по нему щелкаешь, (он должен открыться в отдельном окне) нажимаешь на клаве end и затем букву N. - это устанавливает диапазон рендеринга от начала до конца последнего фрагмента.
теперь жми Ctrl M -в появившемся окне жмешь на Output Module - там устанавливаешь нужные тебе кодеки, и, если хочешь со звуком - галку в audio output.Вобщем - дальше, наверное, разберешься...