Как два пальца... Выделяешь ребро и с зажатым Shift тянешь его.. так создается новый полигон вершинки которого Collapse или Weld соединяешь с другими полигонами и вуаля целая сетка обьекта без дыр
Выделить два ребра, между которыми дырка, нажать bridge(без сегментов)
Затем выделить получившиеся новые рёбра и flow connect(находится в graph modeling tools верхняя панель)