Это зависит от того, какими инструментами потом делать моушнблюр и т.д.
Если родным VectorMotionBlur, то проще прямо в лоадере EXR выбрать соотв. канал напротив X/Y Velocity во вкладке Format.
Если ReelSmartMotionBlurVectors, который использует красный и зеленый, то можно создать отдельный лоадер и выбрать каналы велосити напротив красного и зеленого.
Либо делать первым способом и прицепить следом ChannelBoolean, в котором выбрать велосити в качестве красного и зеленого.