Что есть multi-subobject material в Максе? Это набор материалов(например Standard, хотя могут быть и другие) каждый со своим ID. Каждый из этих материалов назначается компонентам объекта, имеющим аналогичный ID. Просто все эти материалы в Material Editore собраны в кучку и обзваны типом multi-subobject.
В КСИ это реализуется созданием кластеров из полигонов и присвоением им нужного материала. Все эти материалы будут существовать независимо друг от друга. Матерал, примененный к кластеру, имеет больший приоритет, чем материал, примененный ко всему объекту целиком. Если надо навесить один материал на кластеры у разных объектов, то надо сгруппировать кластеры и к группе применить нужный материал.