Если надумал переставлять винды, то лучше всего 2000 и НТ ставить на правильное железо, безглючное, и быстрое.
Если же поставить 2000 или НТ4.0 СП6 на плохое железо, во первых будут тормоза, потом,могут возникнуть проблемы с многими программами
ИМХО
Твоя проблема вызвана не софтом и не виндами, а исключительно сбоями в работе жесткого диска, ты ведь сам записал- при интенсивных дисковых операциях, моя настоятельный совет- менять диск, и посмотреть, что изменилось.
конец ИМХО.
Да, опиши плз свою систему, может станет понятней.