"придать" альфу можно например маской.
если есть существующая отрендренная отдельно албфа то подцепить ее к изображению можно с помощью ChannelBooleans. Или опять же Bitmap-маской.
И битмап маск (Bitmap) и ChannelBooleans находятся в Tools (Tools>Mask>Bitmap, Tools>Color>Channel Booleans). В хелпе можно посмотреть наглядно как ими пользоваться.