Пример:
Открываешь премьер, делаешь новый проект, нажимаешь
File -> Import -> File, (или Ctrl+I) заходишь в директорию где у тебя лежат сиквенсы (допустим они имеют название от @!#$.001.tga до @!#$.100.tga) нажимаешь на первый кадр и чуть ниже нажимаешь кнопЫчку Numbered Stills, потом Open.
Теперь в панельке Project у тебя есть набор сиквенсов объединённых как бы в один файл. Берёшь его левой кнопкой и тянешь и Timeline, нажимаешь Ctrl+M выбираешь место куда сохранить, чуть ниже жмёшь на Settings выбираешь нужные параметры (компрессия там всякая, параметры звука и т.д.) и потом Save...