То есть жмешь в проекте на этот проблемный файл,вызываешь контекстное меню,жмешь Reveal Layer Source in Project,он должен показаться в верхнем окошке "Project",там в этом же файле выбираешь контекстное меню и выбираешь Replace Footage/File,открывается окошко,в нем тебе нужно указать новый путь нахождения файла.И все.