Странно что все всегда наступают на одни и те же грабли и моделируют такие сложные вещи полигонами. Нурбс здесь серьезно облегчил бы задачу.
По делу - постарайтесь сделать сетку пореже, с такой плотной сеткой, не прибегая к разным хитростям, сделать ровную модель почти нереально. Окна стоит отделять в отдельный объект когда моделирование будет завершено, так будет легче и маты и текстуры накладывать
