Перед тем, как спросить, я покопался в своём афтере и его хэлпе... Про файлы *.аек - глухо, как в бочке. Комошен в этот формат тоже вроде не экспортит... Другие софты - не знаю.
Есть софтина Transmotion3D, которая импортит tracker data в Lightwave.
Вот она использует *.aek. Но судя по тому, что я увидел в примере, это просто AE keyframe data, которая создается/подгружается через ctrl-c/ctrl-v...
http://www.ats-3d.com/transmot/tmtute1/tute1.htm
если кому интересно.
P.S. 2pio: Это действительно большой секрет, чем тречили?