Ну, зависит от задачи. Мне например, чаще приходиться голую речь подгонять под видео, менять скорость её, вырезать слова, поэтому я делаю MixDown в Аудишине и синхронизирую с проксей, там же. Если анимацию подгонять, под песню, то конечно в АЕ лучше. Ну, и монтировать какие-то более-менее сложные ролики лучше в монтажнах программах.