Поставь мышку на гизмо. Если подсветить центр , то масштабирует по всем трём осям, если подсветить полоску, соединяющую две оси, то масштабирует по плоскости, ну а если ось , то по оси.
Напрягает только одно. Как бы ты не масштабировал, но размеры габаритного контейнера в свойствах объекта остаются постоянными. Это не очень большая проблема, но об этом свойстве надо знать. Главное что координаты вертексов соответствуют реальным.