Я бы сначала избавился от лишних ребер на куске куба внутри трубы, а потом бы бевелом c fraction=1 и нужным количеством сегментов сгладил грань, и дорезал бы потом все мультикатом. На счет полной автоматизации процесса не шарю, но это все с учетом создания скринов заняло у меня всего пару минут.
