Можно присвоить разным элементам разные material ID, потом использовать соответственно многокомпонентный материал. После этого, для того, чтобы выравнять текстуры, использовать модификатор Unwrap UVW, там есть эдит. Выделяешь нужные полигоны и растягиваешь в этом редакторе текстуру соответственно.