Создать многокомпонентный (Multy/Sub-Обject ) материал (штук 20 слотов), потом посмотреть какие ИД какому месту дерева соответствуют (в режиме edit mesh - face) и туда в материал назначить текстуру.
Помнится это дело несколько кривое было даже на версии 5.1. Типа там ствол дерева на 2-ом ИД, ветки на 7, а потом листья где-то аж на 18-ом!