Именно через скрипт, который будет читать данные (величины/значения), а уж потом, если понадобится, то и преобразовывать их в координаты. Ваши мысли и желания (хотелки) известны только вам.
Так может лучше и не заниматься этим? А, для начала, таки изучить Афтер Эффектс более полнее...
p.s. У меня есть мой скриптик (один из черновиков), который читает построчно текстовый файл (.txt) и записывает эти строки в текстовые слои. Могу подарить... а дальше - самостоятельно - ведь не всё коту масленица.