Раз уж ты решил делать это булем, то слушай как правильно использовать этот глюк. Заметил приятную закономерность этого глюка. После применения буля вычитанием появились дыры, но если отменить операцию и сделать объединение то оно произойдет немного нетак как надо (это нам и нужно). Объдинение произошло аналогично каманде атач (в мешах) за тем лишь исключением что в местах пересечения со вторым операндом образовались точки (а те точки которые должны были исчезнуть при операции не исчезли, а остались внутри первого операнда). Теперь мы удаляем точки вылазящие за второй операнд, конвертим в меш, подобъект на уровне гране, все то что нам нужно уже выделено, говорим флип нормалс. И получаем то что хотели.
Надо вычитать, а мы объединяем. Прикол, но работает. Это гораздо проше и быстрее чем вручную добавлять грани пропавшие после глюка.
Удачи.