Не понятна проблема. Если ты замапила объект, потом сдублировала инстансом, то все UV дубликата полностью повторят оригинал, к слову сказать тут даже инстанс не нужен. Если ты потом поправила UV оригинала, то вместе с ним редактируется и дубликат, в точечности так же.
То есть просто присвой текстуру дубликату да и всё.
Но мне как-то всё ещё не понятна проблема, что-то ты мудришь, ты бы написала поточнее что ты хотела сделать, что делала, и что не получилось...