Можно исходить из расчета 15-30 у.е. за полосу (в зависимости от сложности). Графика рассчитывается отдельно. Здесь возможны варианты: можно считать штучно, можно суммарно.
Подготовка файла к сдаче в типографию под требования последней - это, как известно, обязанность исполнителя (верстальщика, дизайнера), поэтому в дополнительные расходы можно включить только саму возню с размещением, т.е. технический контроль (не один раз съездить в типографию, подергать препресников, при возможности поприсутствовать на пробных распечатках). Стоимость подобного рода услуги зависит, что называется, от жадности - от того, во сколько сам себя оценишь. Бывает ведь, что с печатником вручную краску приходится замешивать, чтоб в цвет попасть.
Обложки тоже отдельная история. Знаю, что стоимость книжной колеблется от 60 до 120 у.е. В периодических изданиях, возможно, иначе. Не сталкивалась.
(Петербург, на всякий случай)