Эта работа не для слабонервных, недавно сам прогнал две конференции со сборниками по 35 и 26 п. л. восьмой доли соответственно. Мы работаем несколько по другой схеме, поскольку все тексты еще и редактируются. Для таких работ базовая программа у нас - Lotus Wordpro. Сырые тексты перегоняем туда из Ворда, делая форматирование практически заново. Формулы перегоняем как объекты Mathtype (это расширенный формульный редактор из Ворда), векторные картинки по схеме Ворд - ПДФ - Илл - eps (шрифты в кривые, часто вносим дополнительную правку), фотографии вытаскиваем тоже из ПДФ. В общем на допечатную подготовку и редактирование для двух сборников ушло примерно 1,5 месяца (правда, были и другие работы). Wordpro используем потому, что, на мой взгляд, он существенно ближе к верстальным программам по сравнению с Вордом, но при этом сохраняет все преимущества текстового процессора (это я о редактировании). Он прекрасно работает с таблицами и (после доводки) вполне сносно с русскоязычными формулами. Кроме того, у него есть очень мощная система стилей. Правда, чтобы его хорошо освоить нужно достаточно много времени.
На выходе имеем вполне нормальный ПДФ. Каждый из последних сборников был сделан как один файл без каких-либо проблем.
Если очень хорошо знаешь Ворд - лучше делай в нем, но имей в виду, что существенные изменения в верстке могут привести к непредсказуемым результатам. В конце концов можно обработать каждый доклад как отдельный файл и потом сделать общую нумерацию страниц и колонтитулы. А вообще я этой идиотской программе не доверяю.
Я знаю людей, которые все это хозяйство засовывают в верстальные программы и дальше мучаются там.
Наконец, я видел сборники докладов, собранные из того, что было - разве что заголовки привели к единому виду, а сами тексты почти не трогали. Все зависит от требований (и, наверно, от сроков).