Да чего угодно
В commotion есть встроенная функция wire-remove, причем как в пэинте, так и в композишине.
Для shake есть плаг от furnace, который очень крут, но требует лицензии (в принципе - обходится
А на highend2d лежит бесплатный скрипт, который тоже вполне.
Да и в афтере, комбашене, фьюжене и чем угодно другом это реализуемо.