Если ты хочешь просто убрать зеленый фон, то в в эффектах "Key->color range" там поймешь (могу не правильно написать название эффекта, но что-то типа, поймешь) после этого эффекта примени эфект matte (опять могу неправильно написать, AE нет под рукой) так уберешь зеленый фон, AE 7.0