Речь идет о трехмере, насколько я понял? Способов масса. Можно, например, сразу делать бесшовные текстуры, но это довольно тяжело для понимания. Если ты работаешь в 3dsmax’e, то там есть такая штука под названием «каналы проекционных координат». Это когда при создании материала используешь композитные (Composite – многослойные) текстуры, а на перекрытия назначаешь альфа-канал, чтоб замаскировать шов.