Если тащить из Майи в АЕ, то мне советовали так "...в майа нужный объект назови ..._null", в АЕ слои будут называться Null_***. Я - не майщик, проверяй сам или спроси где-нибудь ещё. Ставь в Буже на маркерах "Flag for Export"...
Но должно получаться и родным плугином. А так - ерунда какая-то получается. По-любому, при импорте *.ban создаётся две композиции, одна с видео-аспектом и одна вложенная square-pixel. А при импорте *.ма - 50/50: если майский проект - квадратный, то композиция будет одна, а если с каким-нибудь аспектом - то будет так, как написано выше.
НО МАТЕМАТИКА ДВИЖЕНИЯ КАМЕРЫ ОДНА И ТА-ЖЕ!!! Ищи, что у тебя косячит.