вообще то проще было бы сразу рендерить во флэш в максе. есть плагин Illustrate для этого.
а если принципиально надо - то здесь нужно знать инструментарий флэша - в чем я не силен. но я точно знаю, что флэш понимает альфа-канал.
чтобы альфа включалась в отрендеренную максом картинку - нужно сохранять не в жпеге, а в тарге или тифе.