Файл сохранён с включённым Include Linked трам-пам-пам. Acrobat видит эти самые «include», а AI ищет прилинкованные оригиналы.
Сделай так: в Acrobat-е выделяй растры по одному, правая кнопка -> Edit Image. Должен запускаться PhS, и из него ты сможешь сохранить эти картинки в файлы. Их потом и подсунешь AI, когда он их будет просить.
Но при одном условии у тебя всё получится один-в-один — если картинки не попали под действие Flattening.
Тогда можно было бы сохранитья из Acrobat-а в EPS и открывать в AI уже его.
Или, если у тебя Acrobat 6, с помощью PDF Optimizer пересохранить PDF, удалив данные приложения, его создавшего (там есть такая опция).