самый правильный путь пожалуй сделать анимацию 3D лого в Mаксе или любом другом 3Д пакете, сохранить как tga секвенцию с альфа каналом, и потом в примьере уже наложить на верхнюю дорожку с позиционированием через Motion...
хотя в приницпе можно вращение логитипа сделать и в Аффтер Эффектс. =)