> могут ли получаться "проблемные" пдф-ы после дистиллера?
Если гнать через Distiller с имеющимися в стандартном комплекте наборы настроек PDF/X* (надёжнее, поскольку проще устройством — PDF/X-1a), то если будут какие-нибудь проблемы, никакого PDF-а Distiller тебе не выдаст покуда эти проблемы не будут устранены. Но если Disstille через настройки PDF/X-1a создавать PDF не отказался, то можно быть очень во многом уверенным (100-процентно никогда ни в чём уверенным быть нельзя, но очень близко — можно).
> (т.е. появляться какие-нибуть потери)
Это уж как Distiller настроишь.
* Имеется в виду полный комплект Acrobat 6 Professional. Dерсию Standard не виде, потому врать не буду.