Различаются багами !!!!
Чем новее версия, тем больше багов!!!!
Ну еще функции новые и тулзы добаляют!!!!
Правда ни одна новая тулза, начиная с версии 2008 толком так и не работает!!!
Вот, еще, держи !!!! http://en.wikipedia.org/wiki/3ds_Max_release_history
Надеюсь, английский знаешь !!!!!!!!!!!