Можно даже не убивать — чревато перегистрацией заново всех plug-in'ов, достаточно открыть этот файл в Notepad'e, найти в нем вхождение /Character (или /Paragraph). Внутри этого блока будет /Location с координатами /X и /Y palette, выраженных в пикселах экрана. координаты надо исправить во всех палитрах, входящих в группу с названием, указанным внутри скобок в /DockGroup: если ты исправила координаты в /Character, то надо будет их привести в допустимый вид и в /Paragraph — иначе при переключении в Paragraph palette палитра может улететь на прежнее место.