Ну во первых чтоб рендерить в слои для этого есть спец плаги (PSDmanager AFExportChannel) = но с помощью их не то что заточить в слои эффекты но и вааще отредерить эффекты не получается бо эти плаги сами идут как эффекты
__вариант второй рендерить отдельно и сохранять в PNG...но опять же придется спрятать все а эффекты должны отредериться = насколько я знаю со стандартными LensEffects это не прокатывакт...я же замест них юзаю FinalFlares = там так можно
__более грамотно отрендерить отдельно один эффект > PNG > а в Шопе накладывать на артинку , копировать и тд = главное не забывать в Layers>Blend Options >Blend Mode поставить на Ligthen...Удачи