Значит если я тебя правильно понял, то отвечаю на твой вопрос, например у тебя стена, на которой надо сделать 3 окна (все Box)
Выделяешь стену, кликаешь на Boolean, нажимаешь на Pick Boolean и
на 1-ое окно, заметишь что получилось отвестие, далее опять жмешь на Boolean, потом опять Pick Boolean и второе окно, третье аналогичным способом.
Удачи