Обобщю: это бывает с любой рожденной нодой, которая на выходе не выдает геометрии из-за неправильного положения родительской геометрии. Искать обычно приходится методом исключения. Чтоб такого не происходило надо стараться не держать геометрию со сложной историей (убивать историю как только работа над формой закончена). Иногда это бывает, когда забываешь сделать откат после неудачной операции с геометрией (нода создалась, а объект не появился из-за майкиного глюка или неправильных исходных данных)
Что касается обьекта без Shading group, то тут легче проверить: надо выделить все объекты в сцене и назначить на них любой материал. Кстати, по-моему этот глюк появился только в 4.5 мторе а в 4.11 его небыло