Если Кварк это умеет (InD, например, умеет, и PM тоже), экспортируй публикацию в EPS. Поскольку EPS может содежать только одну страницу, каждая страница публикации автоматически уйдёт в отдельный файл.
Потом эти EPS-ы програнать чрез Distiller, и всё.