приходит на ум только одно.Когда меняешь разрешение экрана окно может выскочить за пределы экрана.Тогда при другом разрешении
его никогда не увидишь.Попробуй выставить самое большое разрешение и запусти макс.И положение окон где то записывается.Раньше был файл в корне max что то там *.ini.Щас в 2008 поискал-нету.Иначе просто не знаю что....