Да почти все работают, кроме замешаных на масках или других только для АЕ свойственных функциях и плюс очень старых.
А вообще, что неужели родных функций Фуджика нехватает? Сколько вспоминаю, использую только 2 АЕ плагина: трапкод шейн и борис цилиндр, куб.