Лично я ставлю все оверпринты в EPS, то есть в Иллюстраторе. Если в ИнДизайн грузить AI, то оверпринты не обрабатываются почему-то, это уже обсуждалось в форуме неоднократно.
А вообще прикольно рисовать цветные графики, схемки, блок-схемы прямо в ИнДизайне: тут тебе возможности автотреппинга. К тому же можно все объекты внутри схемки сгруппировать, а потом засунуть во фрейм. График ползет вместе с текстом! Блеск! Попробуй-ка это в кварке сделать...