Есть несколько способов.
1. Создай пустой слой, и русуй на нем что угодно и чем угодно, всё остальное на нём будет прозрачным. Объект(ы) будет растровым.
2. Создай Shape Layer (например, инструментом Rectange Tool), установи Fill Opacity = 0 в Blending Options и задай Stroke нужной толщины, цвета и т.д. Объект получится векторным.
3. Возьми уже имеющийся слой "с дырками" и поступи также, как в п.2.