Смотря как эти метки были сделаны, и в какой версии. Например в новых версиях это эффект. Все живые эффекты редактируются через палитру appearance. Открываем её и удаляем пункт.
Если это CropMarks в старых версиях, то в меню object > crop marks. Если это фильтр (тоже старые версии), то просто выделяем группу линий и удаляем. Если это Trim (еще более старые) -- тоже группа, тоже удаляется.