Я делаю так, отмечаю нужный слой, далее -- ctrl+a, ctrl+c, ctrl+n -- фотошоп выделяет не поверхность всего документа, а только размер объекта в слое, а при открытии нового окна (контрыл эн) - задает размер этого самого элемента.
Фотошоп вообще не очень совершенен, и кнопка element size там не помешала-бы.